CpG imunostimulant dietetic cu text complet fără celule Modulează biomarkeri microARN asociați cu

Prezentare generală a proiectării experimentale. După 7 săptămâni de studiu de hrănire, peștii hrăniți cu ambele diete au fost supuși provocării imune printr-o injecție intraperitoneală (IP) de soluție salină sterilă tamponată cu fosfat (PBS), antigen bacterian Aeromonas salmonicida (ASAL) sau acid polirribocitidilic polirribinoinosinic mimic (pIC) . șabloanele pentru rinichi de cap (HK) pregătite mirVana din trei din fiecare pește injectat cu PBS-, pIC- și ASAL (numai dieta de control) au fost selectate pentru secvențierea profundă pe baza expresiei evaluate qPCR a pIC cunoscut (adică, isg15a, mxb, irf7b) și ASAL (adică, campb, tlr5a, il1b) transcrieri ale biomarkerului imun. MiARN selectivi care răspund la pIC și/sau ASAL au fost studiați prin qPCR folosind toate probele din ambele grupuri dietetice. * Analizele ARNm qPCR au fost efectuate folosind ARN total tratat cu DNază și purificat pe coloană.

imunostimulant

Analize qPCR ale miARN identificate prin secvențierea profundă ca fiind responsive atât la injecțiile pIC, cât și la cele ASAL (n = 8-9). Sunt reprezentate graficele medii log2 RQ-uri cu bare SE. Un asterisc (*) reprezintă o diferență semnificativă între diete în fiecare tratament de injecție (ppx-axă. Pentru calculul qPCR de schimbare a pliurilor, reglarea globală a pliurilor a fost calculată ca 2 A - B ca în Xue și colab. [46], unde A este media log2 RQ din grupurile pIC sau ASAL, iar B este media log2 RQ din grupul PBS potrivit dietelor. (A) miR-27d-1-2-5p; (B) miR-29b- 2-5p; (C) miR-146a-5p; (D) miR-146a-1-2-3p; (E) miR-221-5p;.

Analize qPCR ale miARN-urilor identificate prin secvențierea profundă ca fiind responsive la pIC singur (n = 8-9). Sunt reprezentate graficele medii log2 RQ-uri cu bare SE. Un asterisc (*) reprezintă o diferență semnificativă între diete în fiecare tratament de injecție (ppx-axă. Pentru calculul qPCR de schimbare a pliurilor, reglarea globală a pliurilor a fost calculată ca 2 A - B ca în Xue și colab. [46], unde A este media log2 RQ din grupurile pIC sau ASAL, iar B este media log2 RQ din grupul PBS potrivit dietelor. (A) miR-30e-1-2-3p; (B) miR-135bd- 5p; (C) miR-181a-5-3p; (D) miR-462a-3p.

Analize qPCR ale miARN identificate prin secvențierea profundă ca fiind responsive la ASAL singur (n = 8-9). Sunt reprezentate graficele medii log2 RQ-uri cu bare SE. Un asterisc (*) reprezintă o diferență semnificativă între diete în fiecare tratament de injecție (ppx-axă. Pentru calculul qPCR de schimbare a pliurilor, reglarea globală a pliurilor a fost calculată ca 2 A - B ca în Xue și colab. [46], unde A este media log2 RQ din grupurile pIC sau ASAL, iar B este media log2 RQ din grupul PBS care se potrivește cu dieta. Pentru miARN-uri reglementate în jos, valorile de schimbare a pliurilor au fost inversate (-1/fold- schimbare) (A) miR-192a-5p, (B) miR-194a-5p, (C) miR-725-5p, (D) miR-roman-16-5p, (E) miR-722-3p, ( F)) miR-727a-3p.

Analize qPCR ale expresiei bazale (eșantioane de pre-injecție) ale miARN-urilor sensibile la PIC și/sau ASAL identificate prin secvențierea profundă (n = 8). Sunt reprezentate graficele medii log2 RQ-uri cu bare SE. Un asterisc (*) indică o diferență semnificativă între diete pentru un miARN dat (p A - B ca în Xue și colab. [46], unde A este media log2 RQ din grupul CpG, iar B este media log2 RQ din grupul de control. Pentru miARN-uri reglementate în jos, valorile de schimbare a pliurilor au fost inversate (−1/fold-change). (A) miR-27d-1-2-5p; (B) miR-29b-2 -5p (C) miR-30e-1-2-3p, (D) miR-135bd-5p, (E) miR-146a-5p, (F) miR-146a-1-2-3p, (G) miR - 181a-5-3p; (H) miR-192a-5p; (I) miR-194a-5p; (J) miR-221-5p; (K) miR-462a-3p; (L) miR-722- 3p; (M) miR-725-5p, (N) miR-727a-3p, (O) miR-roman-16-5p.