Studiu de asociere a trei polimorfisme genice identificate recent de o asociație de genom

Institutul pentru Sănătatea Copilului și Adolescentului, Departamentul pentru Sănătatea Copilului, Adolescenților și Femeilor

Școala de sănătate publică, Universitatea din Beijing

Nu. 38 Xueyuan Road, districtul Haidian, 100191 Beijing, China

Articole similare pentru „”

Facebook
Stare de nervozitate
LinkedIn
E-mail

Abstract

Obiectiv: Acest studiu a avut ca scop examinarea asocierilor a trei polimorfisme cu un singur nucleotid (SNP) cu fenotipuri legate de obezitate la copiii chinezi. Acești SNP au fost identificați printr-un studiu recent al asociației la nivel de genom (GWA) în rândul copiilor europeni. Având în vedere că mediile genetice variate în diferite etnii pot duce la asocieri diferite, este necesar să se studieze aceste asociații într-o populație etnică diferită. Metode: Un total de 3.922 copii, inclusiv 2.191 cu greutate normală, 873 supraponderali și 858 copii obezi, din trei studii independente au fost incluși în studiu. Au fost efectuate regresii logistice și liniare și s-au efectuat meta-analize pentru a evalua asocierile dintre SNP și fenotipurile legate de obezitate. Rezultate: Raportul de cote cumulat al alelei A a rs564343 în PACS1 pentru obezitate și obezitate severă au fost 1.180 (p = 0.03) și 1.312 (p = 0.004), respectiv. De asemenea, am constatat că rs564343 a fost asociat nominal cu IMC, scorul deviației standard IMC (IMC-SDS), circumferința taliei și raportul talie-înălțime (p

Introducere

Este larg recunoscut faptul că obezitatea este o problemă de sănătate din ce în ce mai importantă atât în țările dezvoltate, cât și în țările în curs de dezvoltare. O analiză sistematică a raportat recent că prevalența globală a supraponderalității și a obezității a crescut cu 27,5% la adulți și cu 47,1% la copii în ultimele trei decenii [1]. În SUA, peste două treimi (68,5%) dintre adulți și aproape o treime (31,8%) dintre tineri au fost fie supraponderali, fie obezi în 2011-2012 [2]. În China, prevalența supraponderalității și a obezității în rândul băieților și fetelor urbane a fost de 28,14% și 15,56%, iar cea dintre băieții și fetele din mediul rural a fost de 18,62% și 11,81% în 2010, arătând o creștere comparativ cu datele din 2005 [3]. Obezitatea este un factor de risc important al multor boli, inclusiv diabetul zaharat de tip 2, hiperlipidemia, hipertensiunea, bolile cardiovasculare și cancerele [4,5].

Factorii genetici joacă un rol indispensabil în predispoziția individului la obezitate [6,7,8]. Heritabilitatea varianței IMC a variat de la 30% la 70% [9] și se estimează că ereditatea IMC sau a obezității este mai mare la copii decât la adulți [10]. În ultimii ani, studiile de asociere la nivel de genom (GWA) au furnizat dovezi pentru loci de risc genetic pentru obezitate [11,12,13,14]. Multe studii de replicare pentru acești loci au fost efectuate la mai multe populații etnice, inclusiv chinezi [15,16,17,18,19,20]. Două studii publicate recent de Wang și colab. [19] și Meng și colab. [20] din grupul nostru de cercetare au confirmat că unele loci identificate de studiile GWA sunt asociate cu obezitatea la copiii chinezi și au identificat diferența etnică a mărimii efectului pentru unii loci (tabelul suplimentar 1, disponibil la http://content.karger.com/ProdukteDB/produkte.asp?doi=471487).

Un studiu recent GWA a identificat patru noi loci (rs564343 în proteina de sortare a clusterelor acide de fosfofurină 1 (PACS1), rs11109072 în transcrierea asociată cu rabdomiosarcomul 2 (RMST), rs1957894 în protein kinaza C eta (PRKCH) și rs11208659 în receptorul leptinei (LEPR)), care au fost asociate cu obezitate severă cu debut precoce în rândul copiilor europeni [21]. Din câte știm, aceste noi loci nu au fost studiate la populații independente cu etnie diferită. Având în vedere că mediile genetice variate din diferite etnii pot duce la asociații diferite, este necesar să se studieze aceste asociații în diferite populații etnice. Prin urmare, am realizat prezentul studiu pentru 3 loci (PACS1, RMST, PRKCH) cu frecvența alelei minore ≥0.20 pe baza mărimii eșantionului nostru pentru a explora dacă acești loci au fost asociați cu obezitatea la copiii chinezi.

Subiecte și metode

Subiecte

Am realizat trei studii independente cu un total de 3.922 subiecți cu vârste cuprinse între 6-18 ani, recrutați din regiunile urbane din Beijing, China. Primul studiu privind lipidele adolescenților, rezistența la insulină și genele candidate (ALIR) a implicat 937 de participanți din 9 școli medii din districtul Dongcheng din Beijing. Al doilea studiu a fost realizat în cadrul Proiectului cuprinzător de prevenire pentru adolescenții supraponderali și obezi (CPOOA) cu exerciții fizice și nutriție sănătoasă ca instrumente, care a fost realizat în 3 școli gimnaziale și 2 școli elementare din districtul Haidian din Beijing, implicând 1.093 de participanți. Ambele studii sunt studii de caz-control, iar strategiile de constatare și alte informații detaliate au fost descrise anterior [22,23].

Consimțământul informat scris a fost oferit de toți participanții și părinții lor, în cazul minorilor. Primul și al doilea studiu au fost aprobate de Comitetul de Etică al Centrului de Științe de Sănătate al Universității din Beijing, în timp ce al treilea studiu a fost aprobat de Comitetul de Etică al Centrului chinez pentru controlul și prevenirea bolilor.

Măsurători antropometrice, biochimice și ale tensiunii arteriale

Toate măsurătorile din cele trei studii au fost efectuate cu aceleași metode. Măsurătorile antropometrice, inclusiv înălțimea, greutatea, circumferința taliei și șoldului, au fost efectuate conform protocoalelor standard [30]. S-au calculat IMC (kg/m 2) și scorul de deviație standard BMI specific sexului și vârstei (IMC-SDS). Acesta din urmă a fost calculat în funcție de datele de referință de creștere ale Organizației Mondiale a Sănătății pentru copii cu vârste cuprinse între 5-19 ani [31]. S-au prelevat probe de sânge venos în post pentru măsurarea colesterolului total, a trigliceridelor, a colesterolului lipoproteinelor cu densitate mică (LDL-C), a colesterolului lipoproteinelor cu densitate ridicată (HDL-C) și a glucozei plasmatice utilizând autoanalizatorul biochimic (ALIR și CPOOA: Hitachi7060, Tokyo, Japonia; SCICO: Olympus AU400, Tokyo, Japonia). Tensiunea arterială a fost măsurată utilizând un sfigmomanometru cu mercuriu de auscultare cu o dimensiune adecvată a manșetei pentru copii în aceste studii, conform recomandării Grupului de lucru pentru copii și adolescenți al Programului național de educație a tensiunii arteriale ridicate [32]. Presiunile sanguine sistolice și diastolice medii (SBP și DBP) au fost calculate prin media a trei măsurători.

SNPs Selection and Genotyping

Având în vedere mărimea eșantionului (2.191 copii cu greutate normală și 858 copii obezi) și mărimea efectului presupus de 1,2 pentru o frecvență alelică ≥ 0,20, puterea pentru detectarea asocierii pozitive a fost estimată la 75%. Așa că am selectat trei SNP-uri (rs564343, rs11109072 și rs1957894) cu frecvența alelei minore ≥ 0,20 în populația chineză: Baza de date Hapmap: http://hapmap.ncbi.nlm.nih.gov), cu excepția rs11208659 în LEPR (frecvența alelei minore = 0,07). Modelele de teste multiplex SNP nu au reușit pentru un singur SNP (rs1957894 in PRKCH), așa că l-am înlocuit cu un proxy SNP (rs1957893) având un puternic dezechilibru de legătură (r 2 = 1,00) în populația chineză în HapMap Data Release 24/Faza II Nov08http://hapmap.ncbi.nlm.nih.gov).