Analizele funcționale in vitro ale virusului imunodeficienței umane de tip 1 (HIV-1) integrează mutanți

Adăugați la Mendeley

analizele

Abstract

Un studiu funcțional al mutanților integrasei virusului imunodeficienței umane tip 1 (HIV-1) (IN) a fost realizat cu sprijinul unui model intazomic HIV-1 propus recent. În primul rând, am investigat poziția prezisă a domeniului C-terminal (CTD) și flexibilitatea helixului alfa-6 prin mutarea reziduului Ile-203. Acest lucru nu a avut niciun impact asupra reacției de procesare 3 ′, dar a redus reacția de transfer a catenelor și formarea tetramerilor. În al doilea rând, se prevede că resturile Ile-141 ale buclei catalitice și Glu-246 ale CTD vor lega baza Td-3 a ADN-ului viral menținându-l într-o poziție „răsturnată” și stabilizând domeniul nucleului catalitic (CCD) - Interfață CTD. Datele noastre au arătat că interacțiunea Ile-141/Td-3 a fost importantă pentru activitatea de transfer a catenelor și oligomerizarea IN. Interesant este faptul că mutarea reziduului Glu-246 printr-o alanină a îmbunătățit integrările pe jumătate și pe siturile complete, sugerând că acest reziduu nu poate fi optimizat pentru integrare.