Ratele de alungire a traducerii specifice organelor măsurate prin profilarea ribozomilor in vivo bioRxiv
Abstract
Sinteza și degradarea proteinelor sunt procese biologice complexe care implică mai mult de o sută de proteine care funcționează într-o manieră extrem de orientată. În ciuda progresului, sunt disponibile puține opțiuni pentru a accesa traducerea la animalele vii, deoarece creșterea complexității animalelor limitează repertoriul de instrumente experimentale care ar putea fi aplicate pentru a observa și manipula procesele din corpul animalului, organele și celulele individuale. În acest studiu, am dezvoltat o metodă fără etichetare pentru măsurarea ratelor de alungire a traducerii specifice de tip organ și celulă. Se bazează pe livrarea rezolvată în timp a inițierii traducerii și a inhibitorilor de alungire la animale vii, urmată de profilarea ribozomilor. De asemenea, raportează site-urile de inițiere a traducerilor într-un mod specific organului. Folosind această metodă, am constatat că ratele de alungire diferă între organele șoarecilor și le-au determinat a fi 6,8, 5,2 și 4,4 aminoacizi pe sec pentru ficat, rinichi și, respectiv, mușchi scheletic.