Publicații; ZarLab

Grupul nostru publică lucrări care prezintă noi metodologii, descriu rezultatele studiilor care utilizează software-ul nostru și revizuiesc subiectele actuale din domeniul Bioinformaticii. Derulați în jos sau faceți clic aici pentru o listă completă a lucrărilor produse de laboratorul nostru. Din 2013, scriem postări pe blog care rezumă noi lucrări de cercetare și articole de recenzie:

Eskin Eleazar

LaPierre, Nathan; Mangul, Serghei; Alser, Mohammed; Mandric, Igor Wu, Nicholas C; Koslicki, David; Eskin, Eleazar

BMC Genomics, 20 (Suppl 5), pp. 423, 2019, ISSN: 1471-2164 .

Mangul, Serghei; Martin, Lana S; Eskin, Eleazar; Blekhman, Ran

Genomul Biol, 20 (1), pp. 47, 2019, ISSN: 1474-760X .

Duong, Dat; Ahmad, Wasi Uddin; Eskin, Eleazar; Chang, Kai-Wei W; Li, Jingyi Jessica

J Comput Biol, 26 (1), pp. 38-52, 2019, ISSN: 1557-8666 .

Mangul, Serghei; Martin, Lana S; Langmead, Ben; Sanchez-Galan, Javier E; Thomas, Ian; Hormozdiari, Fereydoun; Pevzner, Pavel; Eskin, Eleazar

Nat Biotechnol, 37 (3), pp. 324-326, 2019, ISSN: 1546-1696 .

Mangul, Serghei; Martin, Lana S; Hill, Brian L; Lam, Angela Ka-Mei; Distler, Margaret G; Zelikovsky, Alex Eskin, Eleazar; Flint, Jonathan

Nat Commun, 10 (1), pp. 1393, 2019, ISSN: 2041-1723 .

Mangul, Serghei; Mosqueiro, Thiago; Abdill, Richard J; Duong, Dat; Mitchell, Keith; Sarwal, Varuni; Hill, Brian; Brito, Jaqueline; Littman, Russell Jared; Statz, Benjamin; Lam, Angela Ka-Mei; Dayama, Gargi; Grieneisen, Laura; Martin, Lana S; Flint, Jonathan; Eskin, Eleazar; Blekhman, Ran

PLoS Biol, 17 (6), pp. e3000333, 2019, ISSN: 1545-7885 .

Gai, Lisa; Eskin, Eleazar

Bioinformatică, 34 (13), pp. i467-i474, 2018, ISSN: 1367-4811 .

Hormozdiari, Farhad I; Jung, Junghyun; Eskin, Eleazar; Joo, Jong Wha J

bioRxiv, pp. 498360, 2018 .

Kennedy, Elizabeth M; Goehring, George N; Nichols, Michael H; Robins, Chloe; Mehta, Divya; Klengel, Torsten; Eskin, Eleazar; Smith, Alicia K; Conneely, Karen N

BMC Genomics, 19 (1), pp. 476, 2018, ISSN: 1471-2164 .

Genele 13udotk pentru a explora modul în care metilarea ADN-ului interacționează cu expresia genică, în întregul genom. REZULTATE: Am folosit un cadru de model mixt liniar pentru a evalua corelația metilării ADN la

400udotk CpGs cu expresia genei se modifică la

Transcrieri 13udotk în două seturi de date independente din celulele sanguine umane. Dintre CpG la care metilarea se asociază semnificativ cu transcripția (eCpGs),> 50% sunt distale (> 50udotkb) sau trans (diferit cromozom) de gena corelată. Multe perechi de transcripții eCpG sunt consistente între studii și

90% dintre eCpG-urile vecine se asociază cu aceeași genă, în cadrul studiilor. Am descoperit că potențatorii (P 50% sunt distali (> 50udotkb) sau trans (diferiți cromozomi) față de gena corelată. Multe perechi de transcripții eCpG sunt consistente între studii și

90% dintre eCpG-urile vecine se asociază cu aceeași genă, în cadrul studiilor. Am găsit că potențatori (P Journal Article

Genetică, 2018, ISSN: 1943-2631 .

Mangul, Serghei; Yang, Harry Taegyun; Strauli, Nicolas; Gruhl, Franziska; Porath, Hagit T; Hsieh, Kevin; Chen, Linus; Daley, Timothy; Christenson, Stephanie; Wesolowska-Andersen, Agata; Spreafico, Roberto; Rios, Cydney; Eng, Celeste; Smith, Andrew D; Hernandez, Ryan D; Ophoff, Roel A; Santana, Jose Rodriguez; Levanon, Erez Y; Woodruff, Prescott G; Burchard, Esteban; Seibold, Max A; Shifman, Sagiv; Eskin, Eleazar; Zaitlen, Noah

Genomul Biol, 19 (1), pp. 36, 2018, ISSN: 1474-760X .

Rahmani, Elior; Schweiger, Regev; Shenhav, Liat; Wingert, Theodora; Hofer, Ira; Gabel, Eilon; Eskin, Eleazar; Halperin, Eran

Genomul Biol, 19 (1), pp. 141, 2018, ISSN: 1474-760X .

Wu, Yue; Hormozdiari, Farhad; Joo, Jong Wha J; Eskin, Eleazar

J Comput Biol, 2018, ISSN: 1557-8666 .

Mangul, Serghei; Martin, Lana S; Eskin, Eleazar

Nat Biotechnol, 36 (4), pp. 369-371, 2018, ISSN: 1546-1696 .

Gamazon, Eric R; Segrè, Ayellet V; van de Bunt, Martijn; Wen, Xiaoquan; Xi, Hualin S; Hormozdiari, Farhad; Ongen, Halit; Konkashbaev, Anuar; Derks, Eske M; Aguet, François; Quan, Jie; Nicolae, Dan L; Eskin, Eleazar; Kellis, Manolis; Getz, Gad; McCarthy, Mark I; Dermitzakis, Emmanouil T; Cox, Nancy J; Ardlie, Kristin G

Nat Genet, 50 (7), pp. 956-967, 2018, ISSN: 1546-1718 .

Hormozdiari, Farhad; Gazal, Steven; van de Geijn, Bryce; Finucane, Hilary K; Ju, Chelsea J-T; Loh, Po-Ru R; Schoech, Armin; Reshef, Yakir; Liu, Xuanyao; O'Connor, Luke; Gusev, Alexandru; Eskin, Eleazar; Preț, Alkes L

Nat Genet, 50 (7), pp. 1041-1047, 2018, ISSN: 1546-1718 .

Sul, Jae Hoon; Martin, Lana S; Eskin, Eleazar

PLoS Genet, 14 (12), pp. e1007309, 2018, ISSN: 1553-7404 .

Loohuis, Loes Olde M; Mangul, Serghei; Ori, Anil P S; Jospin, Guillaume; Koslicki, David; Yang, Harry Taegyun; Wu, Timothy; Box, Marco P; Lomen-Hoerth, Catherine; Wiedau-Pazos, Martina; Cantor, Rita M; de Vos, Willem M; Kahn, René S; Eskin, Eleazar; Ophoff, Roel A.

Psihiatrie Transl, 8 (1), pp. 96, 2018, ISSN: 2158-3188 .

Robert Brown Gleb Kichaev, Nicholas Mancuso James Boocock; Pasaniuc, Bogdan

Bioinformatică, pp. btx142, 2017 .

Ritchie, Marylyn D; Davis, Joe R; Aschard, Hugues; Bătălia, Alexis; Conti, David; Du, Mengmeng; Eskin, Eleazar; Fallin, Daniele M; Hsu, Li; Kraft, Peter; Moore, Jason H; Pierce, Brandon L; Bien, Stephanie A; Thomas, Duncan C; Wei, Peng; Montgomery, Stephen B.