Gene Gag domesticite cu text complet gratuit Gena de Drosophila LTR Retrotranspozonii este implicată în

Flux de lucru pentru căutarea și analiza grupurilor de coexpresie pentru gena Gagr și gene cu expresie indusă de virus. DEG - gene exprimate diferit; TFBS - site-uri de legare a factorului de transcripție.

Clustere de coexpresie de gene cu expresie indusă de virus (conform GEO: GSE2828, GSE31542, GSE42255). Genele din grupul cu Gagr (grupul 2) sunt marcate în verde, gena Gagr este marcată cu roșu.

Analiza regiunilor promotor ale genei Gagr și a ortologilor săi. (A) Localizarea siturilor de legare pentru factorii de transcripție Dif, kay și Stat92E în promotorul genei Gagr. (B) Filogramă bazată pe secvențele promotor ale genei Drosophila Gagr; sunt prezentate valorile ramurilor bootstrap (numărul de replici bootstrap este 1000).

Alinierea regiunilor promotor Gagr pentru diferite specii de Drosophila. Caracteristici marcate în culori: TFBS - Site-uri de legare a factorului de transcripție; Dme_TSS_and_5’-UTR - site-ul de început al transcrierii și regiunea 5’-untraslated a D. melanogaster Gagr; ORF - Deschideți cadrul de citire.

---