Staphylococcus epidermidis - microbewiki

O pagină Microbian Biorealm despre gen Stafilococ epidermid

Cuprins

  • 1 Clasificare
    • 1.1 Taxă de comandă superioară
    • 1.2 Specii
  • 2 Descriere și semnificație
  • 3 Structura genomului
  • 4 Structura celulară și metabolism
  • 5 Ecologie
  • 6 Patologie
  • 7 Aplicarea la biotehnologie
  • 8 Cercetări actuale
  • 9 Referințe

Clasificare

Taxă de comandă superioară

epidermidis

Bacterii; Firmicute; Bacillales; Stafilococ (1)

Specii

Specii de gen: Stafilococ epidermid

Alte nume: Micrococcus epidermidis, Albococcus epidermidis, Staphylococcus epidermidis albus (2)

Descriere și semnificație

Stafilococ epidermid este un stafilococ gram-pozitiv și coagulaz-negativ (4). De obicei trăiește pe pielea și mucoasa umană și cele mai frecvente infecții pe catetere și implanturi (5). S. epidermidis este unul dintre cele mai comune cinci organisme care cauzează infecții noscomiale datorită creșterii utilizării biomaterialelor în mediul clinic (8). Agentul patogen nosocomial cauzează infecții pe valvele protetice, șunturi de lichid cefalorahidian, proteze articulare proteze vasculare, valve, precum și în plăgi postoperatorii și tractul urinar. Este, de asemenea, cel mai frecvent organism găsit în sângele pacienților cu transplant de măduvă osoasă și pe cateterele venoase centrale pentru pacienții cu nutriție parenterală totală (4).

S. epidermidis tulpina de la nare sănătoase pentru adulți arată că există multe tipuri de organism la fiecare individ (9). Un obisnuit S. epidermidis tulpina RP62a (ATCC 35984) a fost izolată în Memphis, Tennessee în perioada 1979-1980 într-o largă răspândire a sepsisului cateterului intravascular. RP62a este o tulpină care produce nămol, crește colectiv și formează biofilm. Tratamentul S. epidermidis infecțiile cauzate de biofilm cu antibiotice sunt adesea ineficiente și duc la necesitatea îndepărtării implanturilor (5). O altă tulpină este S. epidermidis ATCC 12228 care nu produce biofilm (7).

Capacitatea de a produce nămol permite agentului patogen să rămână pe biomateriale. Diferite tulpini de S. epidermidis se pot distinge prin faptul că produc sau nu slime. În laboratoarele clinice, S. epidermidis infecțiile sunt studiate prin utilizarea de antibiotice, biotipare, profiluri plasmidice și producția de nămol; întrucât în ​​cercetare se utilizează fagotiparea, serotiparea, analiza enzimatică restricționată și hibridizarea ADN-ADN (4).

Stafilococ epidermid este adesea comparat cu Staphylococcus aureus. Aceste bacterii sunt cei doi agenți patogeni principali din gen datorită unui milion de infecții grave cauzate în spitale pe an. S. epidermidis este specia dominantă care trăiește mai ales pe piele în timp ce S. aureus trăiește mai ales pe suprafețele mucoasei. Deoarece aceste specii sunt rezistente la multe antibiotice și antimicrobiene, singurul tratament rămas pentru majoritatea acestor stafilococi este glicopeptidul antibiotic vancomicină; cu toate acestea, o tulpină rezistentă la vancomicină de S.aureus a fost gasit recent (7).

O problemă controversată pe S. epidermidis argumentează dacă toate tulpinile pot provoca sau nu în mod egal boală și dacă un genotip specific determină o boală specifică (6).

Structura genomului

S-a folosit metoda pistolului aleator pentru a secvența complet

Genomul de 2,6 Mb S. epidermidis RP62a la Institutul pentru Cercetări Genomice (TIGR) (7). Lungimea cromozomului RP62A este de 2.616.530bp, conține 32,10% din conținutul de G + C, 6 operoni ARNr și plasmidă cu 28,080bp și 32% din conținutul de G + C (11). Două plasmide vSe1 și vSe2 au fost identificate în tulpinile RP62a și ATCC 12228 și au gene de proteină a integrazei. Plasmida vSe1 are gene pentru rezistența la cadmiu, în timp ce o a doua sortază specifică tulpină și două proteine ​​de atașare a suprafeței LPXTG sunt codificate de vSe2 din ATCC 12228 (7).

S. epidermidis Genomul RP62A a fost comparat cu genomul ATCC 12228 pentru a analiza și descoperi evoluția virulenței și a rezistenței acestora. Părțile nesincronice ale insulelor genomului sunt locul în care se află diferențele de rezistență și patogenitate. Stafilococii și bacteriile gram-pozitive cu conținut scăzut de GC au ajutat la schimbarea virulenței și a rezistenței acestora. Operonul cap, care este factorul de virulență de sus în Bacillus anthracis se găsește și în S. epidermidis (7).

Când întregul genom al S. aureus și S. epidermidis este analizat, a arătat că sunt sintetice în ansamblu, dar cu diferențe în insulele genomului, profagul integrat, elementele IS, transpozonii compuși și plasmidele integrate (boală și virulență). TIGR a găsit o nouă insulă genomică vSaγ care este conținută în toate S. aureus și S. epidermidis genomi (7).

Structura celulară și metabolism