Publicații - Institutul Salk pentru Studii Biologice

Laboratorul de biologie moleculară și celulară a plantelor

publicații

Institutul Salk pentru Studii Biologice - Publicații

toate publicațiile

Liu, J., Seetharam, AS, Chougule, K., Ou, S., Swentowsky, KW, Gent, JI, Llaca, V., Woodhouse, MR, Manchanda, N., Presting, GG, Kudrna, DA, Alabady, M., Hirsch, CN, Fengler, KA, Ware, D., Michael, TP, Huffford, M.B., Dawe, R.K. Asamblarea fără gol a cromozomilor de porumb utilizând tehnologii de citire lungă. (2020) Biologia genomului. 21 (1): 121. DOI: 10.1186/s13059-020-02029-9

Michael, T.P., VanBuren, R. Construirea genomurilor de plante aproape complete. (2020) Opinia curentă în biologia plantelor. 54: 26-33. DOI: 10.1016/j.pbi.2019.12.009

Poplawski, SG, Garbett, KA, McMahan, RL, Kordasiewicz, HB, Zhao, H., Kennedy, AJ, Goleva, SB, Sanders, TH, Motley, ST, Swayze, EE, Ecker, DJ, Sweatt, JD, Michael, TP, Greer, C.B. O oligonucleotidă antisens duce la transcrierea suprimată a Hdac2 și îmbunătățirea memoriei pe termen lung. (2020) Acizi nucleici Mol Ther. 19: 1399-1412. DOI: 10.1016/j.omtn.2020.01.027

MacKinnon, K.J., Cole, B.J., Yu, C., Coomey, J.H., Hartwick, N.T., Remigereau, MS, Duffy, T., Michael, T.P., Kay, S.A., Hazen, S.P. Modificările temperaturii ambiante sunt indicii predominant în determinarea reglării genelor diurne Brachypodium distachyon. (2020) Fitol nou. DOI: 10.1111/nph.16507

VanBuren, R., Man Wai, C., Wang, X., Pardo, J., Yocca, AE, Wang, H., Chaluvadi, SR, Han, G., Bryant, D., Edger, PP, Messing, J., Sorrells, ME, Mockler, TC, Bennetzen, JL, Michael, TP Stabilitate excepțională a subgenomului și divergență funcțională în tefful de cereale etiopian alotetraploid. (2020) Comunicări despre natură. 11 (1): 884. DOI: 10.1038/s41467-020-14724-z

Acum 1,1 milioane de ani (mya) și că cele două subgenomi au divergut

5.0 mya. În ciuda acestei divergențe, nu detectăm nicio rearanjare structurală pe scară largă, schimburi homoeologe sau pierderi genetice părtinitoare, spre deosebire de multe alte alopoliploide. Cele două subgenomi teff și-au împărțit funcțiile ancestrale pe baza expresiei divergente într-un atlas de expresie divers. Împreună, aceste resurse genomice vor fi utile pentru accelerarea creșterii acestei culturi de cereale subutilizate și pentru informații fundamentale asupra evoluției genomului poliploid.

Silva, S.R., Moraes, A.P., Penha, H.A., Julião, M.H.M., Domingues, D.S., Michael, T.P., Miranda, V.F.O., Varani, A.M. Planta carnivoră terestră aruncă lumină asupra plasticității genomului mediului și a formei de viață. (2019) Revista Internațională de Științe Moleculare. 21 (1). DOI: 10.3390/ijms21010003

Silva, S.R., Pinheiro, D.G., Penha, H.A., Płachno, B.J., Michael, T.P., Meer, E.J., Miranda, V.F.O., Varani, A.M. Variație intraspecifică în speciile morfotipelor bazate pe genomurile cloroplastului. (2019) Revista Internațională de Științe Moleculare. 20 (24). DOI: 10.3390/ijms20246130

Chekan, J.R., McKinnie, S.M.K., Moore, M.L., Poplawski, S.G., Michael, T.P., Moore, B.S. Biosinteza scalabilă a algelor neurochimice, acid kainic. (2019) Chimie Aplicată. 58 (25): 8454-8457. DOI: 10.1002/anie.201902910

Wai, C.M., Weise, S.E., Ozersky, P., Mockler, T.C., Michael, T.P., VanBuren, R. Ora din zi și reprogramarea rețelei în timpul secetei induse de fotosinteza CAM în albumul Sedum. (2019) PLOS Genetica. 15 (6): e1008209. DOI: 10.1371/journal.pgen.1008209

Jupe, F., Rivkin, A.C., Michael, T.P., Zander, M., Motley, S.T., Sandoval, J.P., Slotkin, R.K., Chen, H., Castanon, R., Nery, J.R., Ecker, J.R. Arhitectura complexă și impactul epigenomic al inserțiilor ADN-ului vegetal. (2019) PLOS Genetica. 15 (1): e1007819. DOI: 10.1371/journal.pgen.1007819

Chu, P., Wilson, G.M., Michael, T.P., Vaiciunas, J., Honig, J., Lam, E. Abordare ghidată în secvență pentru genotiparea clonelor și speciilor de plante folosind gene polimorfe legate de NB-ARC. (2018) Biologia moleculară a plantelor. 98 (3): 219-231. DOI: 10.1007/s11103-018-0774-1

Michael, T.P., Jupe, F., Bemm, F., Motley, S.T., Sandoval, J.P., Lanz, C., Loudet, O., Weigel, D., Ecker, J.R. Asamblare genomică Arabidopsis thaliana de contiguitate ridicată cu o singură celulă de flux nanopore. (2018) Comunicări despre natură. 9 (1): 541. DOI: 10.1038/s41467-018-03016-2

Minich, J.J., Morris, M.M., Brown, M., Doane, M., Edwards, MS, Michael, T.P., Dinsdale, E.A. Temperatura ridicată determină disbioza microbiomului de alge, în timp ce dioxidul de carbon ridicat induce perturbarea microbiomului apei. (2018) Plus unu. 13 (2): e0192772. DOI: 10.1371/journal.pone.0192772

VanBuren, R., Wai, C.M., Ou, S., Pardo, J., Bryant, D., Jiang, N., Mockler, T.C., Edger, P., Michael, T.P. Variație extremă de haplotip în clubmoss tolerant la desicare Selaginella lepidophylla. (2018) Comunicări despre natură. 9 (1): 13. DOI: 10.1038/s41467-017-02546-5