Modificări ale viromului mucoasei intestinale în colita ulcerativă
Obiectiv Patogeneza UC se referă la disbioza microbiotei intestinale. Postulăm că modificările comunității virale care populează mucoasa intestinală joacă un rol important în patogeneza UC. Acest studiu își propune să caracterizeze viromul mucoasei și funcțiile lor în sănătate și UC.
Proiecta Secvențierea metagenomică profundă a preparatelor de particule asemănătoare virusului și secvențierea bacteriană a ARNr 16S au fost efectuate pe mucoasa rectală a 167 subiecți din trei regiuni geografice diferite din China (UC = 91; controale sănătoase = 76). Modificările virome și bacteriomice ale mucoasei UC au fost evaluate și corelate cu metadatele pacientului. Am aplicat partiția în jurul algoritmului de grupare a medoizilor și am clasificat comunitățile virale ale mucoasei în două grupuri, denumite metacomunități 1 și 2 ale virusului mucoasei.
Rezultate În UC, a existat o expansiune a virusurilor mucoasei, în special a bacteriofagilor Caudovirales, și o scădere a diversității, bogăției și uniformității mucoasei Caudovirales comparativ cu controalele sănătoase. Viromul mucoasei modificat corelat cu inflamația intestinală. Disimilitatea interindividuală între virusurile mucoasei a fost mai mare în UC decât martorii. Fagul Escherichia și fagul Enterobacteria au fost mai abundente în mucoasa UC decât martorii. Comparativ cu metacomunitatea 1, metacomunitatea 2 a fost predominată de subiecții UC și a prezentat o pierdere semnificativă a diferitelor specii virale. Pacienții cu UC au prezentat o abrogare substanțială a diverselor funcții virale, în timp ce funcțiile virale multiple, în special funcțiile bacteriofagilor asociate cu capacitatea și patogenitatea bacteriilor gazdă, au fost îmbogățite în mod semnificativ în mucoasa UC. Corelațiile intensive de transkingdom între virusurile mucoasei și bacteriile au fost semnificativ epuizate în UC.
Concluzie Am demonstrat pentru prima dată că UC se caracterizează prin modificări substanțiale ale virobiotei mucoasei cu distorsiuni funcționale. Îmbogățirea bacteriofagelor Caudovirales, creșterea funcțiilor de virulență a fagilor/bacteriilor și pierderea corelațiilor viralo-bacteriene în mucoasa UC evidențiază faptul că viromul mucoasei poate juca un rol important în patogeneza UC.
- mucoasa intestinului
- virome
- bacterii
- metacomunitate virome
- colită ulcerativă
Acesta este un articol cu acces liber distribuit în conformitate cu licența Creative Commons Attribution Non Commercial (CC BY-NC 4.0), care permite altora să distribuie, să remixeze, să adapteze, să construiască pe această lucrare necomercial și să licențieze lucrările derivate pe diferite condiții, cu condiția ca lucrarea originală să fie citată în mod corespunzător, să se acorde creditul corespunzător, să se indice orice modificare făcută și utilizarea nu este comercială. A se vedea: http://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/.
Statistici de pe Altmetric.com
Semnificația acestui studiu
Ceea ce se știe deja pe acest subiect?
Au fost raportate modificări ale bacteriilor fecale și ale viromului fecal la pacienții cu IBD.
Pacienții cu UC au prezentat o expansiune a bacteriofagelor Caudovirales și a bogăției speciilor Caudovirales în scaun.
Care sunt noile descoperiri?
Am demonstrat pentru prima dată că UC se caracterizează prin modificări ale virobiotei mucoasei cu distorsiuni funcționale.
Mucoasa UC a arătat o abundență mare de viruși ADN, în special bacteriofagi Caudovirales, dar o diversitate, bogăție și uniformitate Caudovirales scăzută. Inflamarea mucoasei intestinale a fost asociată cu aceste modificări.