Comparația genomurilor de mamifere carnivore, omnivore și erbivore cu un nou ansamblu de leopard
Soonok Kim
1 Divizia de evaluare a resurselor biologice și genetice, Institutul Național de Resurse Biologice, Incheon, 22689 Republica Coreea
Yun Sung Cho
2 Institutul de Genomică, Institutul Național de Știință și Tehnologie Ulsan (UNIST), Ulsan, 44919 Republica Coreea
3 Departamentul de Inginerie Biomedică, Școala de Științe ale Vieții, Institutul Național de Știință și Tehnologie Ulsan (UNIST), Ulsan, 44919 Republica Coreea
4 Personal Genomics Institute, Genome Research Foundation, Cheongju, 28160 Republica Coreea
Hak-Min Kim
2 Institutul de Genomică, Institutul Național de Știință și Tehnologie Ulsan (UNIST), Ulsan, 44919 Republica Coreea
3 Departamentul de Inginerie Biomedică, Școala de Științe ale Vieții, Institutul Național de Știință și Tehnologie Ulsan (UNIST), Ulsan, 44919 Republica Coreea
Oksung Chung
4 Personal Genomics Institute, Genome Research Foundation, Cheongju, 28160 Republica Coreea
Hyunho Kim
5 Geromics, Ulsan, 44919 Republica Coreea
Sungwoong Jho
4 Personal Genomics Institute, Genome Research Foundation, Cheongju, 28160 Republica Coreea
Hong Seomun
6 Divizia de resurse animale, Institutul Național de Resurse Biologice, Incheon, 22689 Republica Coreea
Jeongho Kim
7 Cheongju Zoo, Cheongju, 28311 Republica Coreea
Woo Young Bang
1 Divizia de evaluare a resurselor biologice și genetice, Institutul Național de Resurse Biologice, Incheon, 22689 Republica Coreea
Changmu Kim
1 Divizia de evaluare a resurselor biologice și genetice, Institutul Național de Resurse Biologice, Incheon, 22689 Republica Coreea
Junghwa An
6 Divizia de resurse animale, Institutul Național de Resurse Biologice, Incheon, 22689 Republica Coreea
Chang Hwan Bae
1 Divizia de evaluare a resurselor biologice și genetice, Institutul Național de Resurse Biologice, Incheon, 22689 Republica Coreea
Youngjune Bhak
2 Institutul de Genomică, Institutul Național de Știință și Tehnologie Ulsan (UNIST), Ulsan, 44919 Republica Coreea
Sungwon Jeon
2 Institutul de Genomică, Institutul Național de Știință și Tehnologie Ulsan (UNIST), Ulsan, 44919 Republica Coreea
3 Departamentul de Inginerie Biomedică, Școala de Științe ale Vieții, Institutul Național de Știință și Tehnologie Ulsan (UNIST), Ulsan, 44919 Republica Coreea
Hyejun Yoon
2 Institutul de Genomică, Institutul Național de Știință și Tehnologie Ulsan (UNIST), Ulsan, 44919 Republica Coreea
3 Departamentul de Inginerie Biomedică, Școala de Științe ale Vieții, Institutul Național de Știință și Tehnologie Ulsan (UNIST), Ulsan, 44919 Republica Coreea
Yumi Kim
2 Institutul de Genomică, Institutul Național de Știință și Tehnologie Ulsan (UNIST), Ulsan, 44919 Republica Coreea
JeHoon iun
4 Personal Genomics Institute, Genome Research Foundation, Cheongju, 28160 Republica Coreea
5 Geromics, Ulsan, 44919 Republica Coreea
HyeJin Lee
4 Personal Genomics Institute, Genome Research Foundation, Cheongju, 28160 Republica Coreea
5 Geromics, Ulsan, 44919 Republica Coreea
Suan Cho
4 Personal Genomics Institute, Genome Research Foundation, Cheongju, 28160 Republica Coreea
5 Geromics, Ulsan, 44919 Republica Coreea
Olga Uphyrkina
8 Institutul de Biologie și Știința Solului, Filiala Orientului Îndepărtat a Academiei Ruse de Științe, Vladivostok, 690022 Rusia
Aleksey Kostyria
8 Institutul de Biologie și Știința Solului, Filiala Orientului Îndepărtat a Academiei Ruse de Științe, Vladivostok, 690022 Rusia
John Goodrich
9 Panthera, New York, NY 10018 SUA
Dale Miquelle
10 Wildlife Conservation Society, 2300 Southern Boulevard, Bronx, NY 10460 SUA
11 Departamentul de ecologie, Universitatea Federală din Orientul Îndepărtat, Ayaks, Islanda Rusă, Vladivostok, 690950 Rusia
Melody Roelke
Programul 12 Laborator de Științe Animale, Leidos Biomedical Research Inc., Laboratorul Național Frederick, Frederick, MD 21702 SUA
John Lewis
13 International Zoo Veterinary Group (UK) IZVG LLP, Station House, Parkwood Street, Keighley, BD21 4NQ UK
Andrey Yurchenko
14 Theodosius Dobzhansky Center for Genome Bioinformatics, St. Universitatea de Stat St. Petersburg, St. Petersburg, 199004 Rusia
Anton Bankevich
15 Centrul pentru Biotehnologie Algoritmică, Institutul de Biomedicină Translațională, St. Universitatea de Stat St. Petersburg, St. Petersburg, 199034 Rusia
Juok Cho
16 Broad Institute of MIT și Harvard, Cambridge, MA 02142 SUA
Semin Lee
2 Institutul de Genomică, Institutul Național de Știință și Tehnologie Ulsan (UNIST), Ulsan, 44919 Republica Coreea
3 Departamentul de Inginerie Biomedică, Școala de Științe ale Vieții, Institutul Național de Știință și Tehnologie Ulsan (UNIST), Ulsan, 44919 Republica Coreea
17 Departamentul de informatică biomedicală, Harvard Medical School, Boston, MA 02115 SUA
Jeremy S. Edwards
18 Chimie și biologie chimică, UNM Comprehensive Cancer Center, Universitatea din New Mexico, Albuquerque, NM 87131 SUA
Jessica A. Weber
19 Departamentul de Biologie, Universitatea din New Mexico, Albuquerque, NM 87131 SUA
Jo Cook
20 Zoological Society of London, Londra, NW1 4RY UK
Sangsoo Kim
21 Departamentul de Bioinformatică și Științele Vieții, Universitatea Soongsil, Seul, 06978 Republica Coreea
Hang Lee
22 Conservation Genome Resource Bank for Korean Wildlife, College of Veterinary Medicine, Seoul National University, Seoul, 08826 Republica Coreea
Andrea Manica
23 Departamentul de Zoologie, Universitatea din Cambridge, Downing Street, Cambridge, CB2 3EJ UK
Ilbeum Lee
24 Daejeon O-World, Daejeon, 35073 Republica Coreea
Stephen J. O'Brien
14 Theodosius Dobzhansky Center for Genome Bioinformatics, St. Universitatea de Stat St. Petersburg, St. Petersburg, 199004 Rusia
25 Oceanographic Center 8000 N. Ocean Drive, Nova Southeastern University, Ft Lauderdale, FL 33004 SUA
Jong Bhak
2 Institutul de Genomică, Institutul Național de Știință și Tehnologie Ulsan (UNIST), Ulsan, 44919 Republica Coreea
3 Departamentul de Inginerie Biomedică, Școala de Științe ale Vieții, Institutul Național de Știință și Tehnologie Ulsan (UNIST), Ulsan, 44919 Republica Coreea
4 Personal Genomics Institute, Genome Research Foundation, Cheongju, 28160 Republica Coreea
5 Geromics, Ulsan, 44919 Republica Coreea
Joo-Hong Yeo
1 Divizia de evaluare a resurselor biologice și genetice, Institutul Național de Resurse Biologice, Incheon, 22689 Republica Coreea
Date asociate
Proiectul de pușcă cu genom întreg leopard a fost depus la DDBJ/EMBL/GenBank sub aderare> LQGZ00000000. Versiunea descrisă în această lucrare este versiunea> LQGZ01000000. Citirile secvențiale ADN brute au fost trimise la baza de date NCBI Sequence Read Archive (SRA321193). Toate datele utilizate în acest studiu sunt disponibile și de pe ftp://biodisk.org/Distribute/Leopard/.
Abstract
fundal
Există trei grupuri dietetice principale la mamifere: carnivore, omnivore și erbivore. În prezent, există o perspectivă comparativă limitată a genomicii asupra evoluției specializărilor dietetice la mamifere. Datorită progreselor recente în tehnologiile de secvențiere, am reușit să efectuăm analize aprofundate ale genomului întreg al reprezentanților acestor trei grupuri dietetice.