Analiza dietei moleculare a larvelor Anguilliformes leptocephalus colectate în nordul vestic

Conceptualizare roluri, curatare date, analiză formală, investigație, metodologie, administrare proiect, resurse, validare, vizualizare, scriere - schiță originală, scriere - revizuire și editare

anguilliformes

Afiliere Institutul Național de Cercetare în Știința Pescuitului, Agenția Japoneză pentru Cercetare și Educație în domeniul Pescuitului, Kanazawa, Yokohama, Japonia

Roluri Conceptualizare, Investigație, Metodologie, Scriere - schiță originală, Scriere - recenzie și editare

Afilieri Institutul Național de Cercetare în Știința Pescuitului, Agenția Japoneză de Cercetare și Educație în domeniul Pescuitului, Kanazawa, Yokohama, Japonia, Institutul de Cercetare inginerie civilă pentru regiunea rece, Institutul de cercetare a lucrărilor publice, Sapporo, Hokkaido, Japonia

Roluri Arhivarea datelor, Resurse, Scriere - revizuire și editare

Afiliere Institutul Național de Cercetare în Știința Pescuitului, Agenția Japoneză pentru Cercetare și Educație în domeniul Pescuitului, Kanazawa, Yokohama, Japonia

Roluri Achiziție finanțare, administrare proiect

Afiliere Institutul Național de Cercetare în Știința Pescuitului, Agenția Japoneză pentru Cercetare și Educație în domeniul Pescuitului, Kanazawa, Yokohama, Japonia

Roluri Arhivarea datelor, analiză formală, investigație

Afiliere Institutul Național de Cercetare în Știința Pescuitului, Agenția Japoneză pentru Cercetare și Educație în domeniul Pescuitului, Kanazawa, Yokohama, Japonia

Investigarea rolurilor, resurse

Afiliere Institutul Național de Cercetare în Știința Pescuitului, Agenția Japoneză pentru Cercetare și Educație în domeniul Pescuitului, Kanazawa, Yokohama, Japonia

Afilierea Institutului de Cercetare în Acvacultură, Universitatea Kindai, Higashimuro, Wakayama, Japonia

Roluri Achiziție finanțare, investigație, administrare proiect

Afiliere Tohoku Institutul Național de Cercetare în domeniul Pescuitului, Agenția Japoneză de Cercetare și Educație în domeniul Pescuitului, Shiogama, Miyagi, Japonia

Roluri Curarea datelor, Analiza formală

Afiliere RIKEN Center for Sustainable Resource Science, Tsurumi, Yokohama, Japonia

Roluri Arhivarea datelor, Analiza formală, Scriere - revizuire și editare

Afiliere RIKEN Center for Sustainable Resource Science, Tsurumi, Yokohama, Japonia

Investigații de roluri, scriere - recenzie și editare

Afișare Stația Shibushi, Institutul Național de Cercetare în Acvacultură, Agenția Japoneză de Cercetare și Educație în domeniul Pescuitului, Shibushi, Kagoshima, Japonia

Roluri Arhivarea datelor, analiză formală, validare, vizualizare, scriere - revizuire și editare

Afiliere Institutul Național de Cercetare în Știința Pescuitului, Agenția Japoneză pentru Cercetare și Educație în domeniul Pescuitului, Kanazawa, Yokohama, Japonia

  • Chow-ul tău,
  • Nobuharu Inaba,
  • Satoshi Nagai,
  • Hiroaki Kurogi,
  • Yoji Nakamura,
  • Takashi Yanagimoto,
  • Hideki Tanaka,
  • Daisuke Hasegawa,
  • Taiga Asakura,
  • Jun Kikuchi

Cifre

Abstract

Citare: Chow S, Inaba N, Nagai S, Kurogi H, Nakamura Y, Yanagimoto T și colab. (2019) Analiza dietei moleculare a larvelor Anguilliformes leptocephalus colectate în vestul Pacificului de Nord. PLoS ONE 14 (11): e0225610. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0225610

Editor: Rachel S. Poretsky, Universitatea din Illinois la Chicago, STATELE UNITE

Primit: 10 iulie 2019; Admis: 7 noiembrie 2019; Publicat: 27 noiembrie 2019

Disponibilitatea datelor: Toate datele secvenței sunt disponibile la LC439371 - LC439410, LC464077 - LC464098, LC474264 - LC474368.

Finanțarea: Această lucrare a fost susținută de subvenții din cadrul Proiectului instituției de avansare a cercetării tehnologice bio-orientate, NARO (proiectul schemei speciale privind cercetarea și dezvoltarea avansată pentru tehnologia de generație următoare) către DH.

Interese concurente: Autorii au declarat că nu există interese concurente.

Introducere

Analizele moleculare au fost folosite recent pentru a determina conținutul intestinal al leptocefalilor. Deși secvențe de ADNr 18S dintr-o mare varietate de organisme planctonice au fost detectate din intestinul anghilei europene (A. anguilla) leptocefalii, zooplanctonul gelatinos (meduza hidrozoană) a fost suspectat a fi dieta principală [12]. Cu toate acestea, nu s-a găsit ADN ribozomal animal (distanțier transcris intern 1) în probele intestinale de leptocefali japonezi de anghilă, iar materialul deja degradat a fost suspectat în dietă [13]. Recent, a fost aplicată o analiză metagenomică mai avansată care utilizează secvențierea generației următoare (NGS), relevând că 76% din citirile ADNr 18S recuperate din intestinul leptocefalului anghilelor europene aparțin filumului Cnidaria [14]. Cu toate acestea, consumul de meduze cnidare este în contradicție cu rezultatele analizei stabile a izotopilor, în care pozițiile trofice ale leptocefalilor au fost raportate a fi scăzute [6,15-19]. O problemă inerentă în studiile moleculare anterioare [12-14] este că nu a fost analizat niciun specimen de pe suprafața corpului leptocefalilor, care ar putea fi o sursă majoră de contaminare încrucișată.