Afilieri curente

afilieri

Dr. Grupul de cercetare al Anna Panchenko studiază mecanismele genetice și epigenetice ale cancerului, inclusiv efectele mutațiilor asupra activității, interacțiunilor și dinamicii proteinelor. Pentru a face acest lucru, grupul ei proiectează noi metode de calcul și algoritmi care implică învățarea automată, modelarea moleculară și simulări de dinamică moleculară.

Dr. Panchenko este deosebit de interesat în descoperirea mutațiilor care conduc la cancer cu abordări computaționale și hibride, astfel încât să putem înțelege mai bine - și eventual să oprim - cauzele progresiei cancerului.

Dr. Panchenko este profesor la Facultatea de Științe ale Sănătății de la Universitatea Queen’s și investigator principal OICR. Deține o catedră de cercetare Canada de nivel I.

Afilieri curente

  • Investigator principal, OICR
  • Profesor, Facultatea de Științe ale Sănătății, Universitatea Queen’s
  • Catedra de cercetare Canada, Tier I

Interese de cercetare

  • Structura și funcția proteinelor
  • Dinamica cromatinei și nucleozomilor
  • Epigenetica carcinogenezei
  • Mutageneza cancerului

Selectați publicații

  • Brown AL, Li M, Goncearenco A, Panchenko AR. Găsirea mutațiilor conducătorului auto în cancer: Elucidarea rolului proceselor mutaționale de fond. PLoS Comput Biol. 2019; 15 (4): e1006981.
  • Shaytan AK, Xiao H, Armeev GA, ..., Panchenko AR. Interpretarea structurală a experimentelor de amprentă radicală hidroxil-radicală ADN-proteină cu rezoluție ridicată folosind HIDROID. Nat Protoc. 2018; 13 (11): 2535-2556.
  • Goncearenco A, Rager SL, Li M, ..., Panchenko AR. Explorarea proceselor mutaționale de fond pentru a descifra eterogenitatea genetică a cancerului. Acizi nucleici Res. 2017; 45 (W1): W514-W522.
  • Li M, Kales SC, Ma K, ..., Panchenko AR. Echilibrarea stabilității și activității proteinelor în cancer: o nouă abordare pentru identificarea mutațiilor șoferului care afectează activarea CBL Ubiquitin Ligase. Cancer Res. 2016; 76 (3): 561-71.
  • Li M, Simonetti F., Panchenko AR. MutaBind estimează și interpretează efectele variantelor de secvență asupra interacțiunilor proteină-proteină. Acizi nucleici Res. 2016; 44 (W1): W494-501.