Topografia suprafeței proteinelor ca instrument pentru a spori activitatea selectivă a unui canal de potasiu

↵ 1 Acești autori au contribuit în mod egal la această lucrare.

suprafeței

Editat de Wolfgang Peti

Abstract

Tk-hefu este o peptidă artificială concepută pe baza eșafodului α-hairpinin, care blochează selectiv canalele de potasiu cu tensiune Kv1.3. Aici vă prezentăm structura spațială rezolvată prin spectroscopie RMN și analizăm interacțiunea cu canalele folosind modelarea computerizată. Aplicăm topografia suprafeței proteinelor pentru a sugera mutații și pentru a crește afinitatea Tk-hefu la izoforma canalului Kv1.3. Proiectăm suprafața funcțională a Tk-hefu pentru a se potrivi mai bine cu suprafața respectivă a vestibulului porilor canalului. Peptida rezultată Tk-hefu-2 păstrează selectivitatea Kv1.3 și afișează o activitate de aproximativ 15 ori mai mare comparativ cu Tk-hefu. Verificăm modul de legare Tk-hefu-2 la canalul vestibul exterior experimental prin mutageneză direcționată către sit. Susținem că ingineria schelelor ajutată de topografia suprafeței proteinelor reprezintă un instrument fiabil pentru proiectarea și optimizarea liganzilor specifici ai canalelor ionice.