PhoB - Proteină reglatoare transcripțională a fosfatului regulon PhoB - Pseudomonas aeruginosa (tulpină

Scorul adnotării: 4 din 5

regulon

Scorul de adnotare oferă o măsură euristică a conținutului de adnotare al unei intrări sau proteome UniProtKB. Acest scor nu poti să fie utilizat ca o măsură a acurateței adnotării, deoarece nu putem defini „adnotarea corectă” pentru nicio proteină dată.

- Proteine ​​deduse din omologie i

Acest lucru indică tipul de dovezi care susține existența proteinei. Rețineți că dovada „existenței proteinelor” nu oferă informații cu privire la acuratețea sau corectitudinea secvențelor afișate.

Selectați o secțiune din stânga pentru a vedea conținutul.

Această secțiune oferă orice informații utile despre proteine, în principal cunoștințe biologice.

Regiuni

Această subsecțiune a secțiunii Funcție specifică poziția și tipul fiecărui domeniu de legare a ADN-ului prezent în proteină.

Informații validate manual, generate de sistemul automat de adnotare UniProtKB.

Afirmare manuală conform regulilor i

Proiectul Gene Ontology (GO) oferă un set de vocabular controlat ierarhic împărțit în 3 categorii:

GO - Funcția moleculară i

Dedus din aspectul biologic al strămoșului

Un tip de dovadă filogenetică prin care un aspect al unui descendent este dedus prin caracterizarea unui aspect al unei gene ancestrale.

Mai multe informații în ghidul codului de probă GO

Dedus din aspectul biologic al strămoșului i

GO - Proces biologic i

Se deduce din fenotipul mutant

Descrie adnotările care se concluzionează din examinarea variațiilor sau modificărilor unui produs genetic, cum ar fi mutațiile sau nivelurile anormale și include tehnici precum eliminări, supraexpresie, experimente anti-simț și utilizarea inhibitorilor de proteine ​​specifice.

Mai multe informații în ghidul codului de probă GO

Se deduce din fenotipul mutant i

Se deduce din modelul de expresie

Acoperă cazurile în care adnotarea este dedusă din momentul sau locația de exprimare a unei gene.

Mai multe informații în ghidul codului de probă GO

Dedus din modelul de expresie i

Cuvintele cheie UniProtKB constituie un vocabular controlat cu o structură ierarhică. Cuvintele cheie rezumă conținutul unei intrări UniProtKB și facilitează căutarea proteinelor de interes.

Baze de date cu enzime și căi

Colecția BioCyc de baze de date Pathway/Genome

Această secțiune oferă informații despre numele și sinonimele (proteinele) și genele și despre organismul care este sursa secvenței de proteine.

Nume și taxonomie i

Această subsecțiune a secțiunii Nume și taxonomie oferă o listă exhaustivă a tuturor denumirilor proteinelor, de la cele utilizate în mod obișnuit până la învechire, pentru a permite identificarea fără echivoc a unei proteine.

Această subsecțiune a secțiunii Nume și taxonomie indică numele (numele) genei care codifică secvența (secvențele) de proteine ​​descrise în intrare. Există patru jetoane distincte: „Nume”, „Sinonime”, „Nume de locus ordonat” și „Nume ORF”.

Această subsecțiune a secțiunii Nume și taxonomie oferă informații cu privire la numele (numele) organismului care este sursa secvenței de proteine.

Această subsecțiune a secțiunii Nume și taxonomie arată identificatorul unic atribuit de NCBI organismului sursă al proteinei. Acesta este cunoscut sub numele de „identificator taxonomic” sau „taxid”.

Această subsecțiune a secțiunii Numele și taxonomia conține linia de clasificare ierarhică taxonomică a organismului sursă. Acesta listează nodurile așa cum apar de sus în jos în arborele taxonomic, cu gruparea mai generală listată mai întâi.

Această subsecțiune a secțiunii Nume și taxonomie este prezentă pentru intrările care fac parte dintr-un proteom, adică a unui set de proteine ​​considerate a fi exprimate de organisme ale căror genomi au fost complet secvențați.

Un proteom UniProt poate consta din mai multe componente.
Numele componentei se referă la componenta genomică care codifică un set de proteine.

Baze de date specifice organismelor

Baza de date a genomului Pseudomonas

Această secțiune oferă informații despre localizarea și topologia proteinei mature din celulă.

Localizarea subcelulară i

GO - Componenta celulară i

    citosol Sursa: GO_Central Dedus din aspectul biologic al strămoșului i

    Cuvinte cheie - Componenta celulară i

    Această secțiune oferă informații despre boala (bolile) și fenotipul (ele) asociate cu o proteină.

    Patologie și Biotehnologie i

    Această subsecțiune a secțiunii „Patologie și biotehnologie” descrie efectele in vivo cauzate de ablația genei (sau a unuia sau mai multor transcrieri) care codifică proteina descrisă în intrare. Aceasta include eliminarea și eliminarea genelor, cu condiția ca experimentele să fi fost efectuate în contextul unui organism întreg sau a unui țesut specific, și nu la nivelul unei singure celule.

    Fenotip de întrerupere i

    Informații curate manual pentru care există dovezi experimentale publicate.