Numărul redus de copii ale genei amilazei salivare predispune la obezitate Nature Genetics
Subiecte
Abstract
Variantele comune ale numărului de copii multi-alelice (CNV) par îmbogățite pentru asociațiile fenotipice în comparație cu omologii lor bialelelici 1,2,3,4. Aici am investigat influența efectelor de dozare a genelor asupra adipozității printr-un studiu de asociere CNV a nivelurilor de expresie genică în țesutul adipos. Am identificat o asociere semnificativă a unui CNV multi-alelic care cuprinde gena amilazei salivare (AMY1) cu indicele de masă corporală (IMC) și obezitate și am reprodus această constatare la 6200 de subiecți. A crescut AMY1 numărul de copii a fost asociat pozitiv atât cu expresia genei amilazei ( = 2,31 × 10 −14) și nivelurile enzimei serice −16), în timp ce redus AMY1 numărul de copii a fost asociat cu IMC crescut (modificarea IMC pe copie estimată = -0,15 (0,02) kg/m 2; = 6,93 × 10 −10) și riscul de obezitate (odds ratio (OR) pe copie estimată = 1,19, 95% interval de încredere (IC) = 1,13-1,26; = 1,46 × 10 −10). Valoarea SAU de 1,19 pe copie a AMY1 se traduce prin aproximativ o diferență de opt ori în ceea ce privește riscul de obezitate între subiecții din partea de sus (numărul de copii> 9) și de jos
Opțiuni de acces
Abonați-vă la Jurnal
Obțineți acces complet la jurnal timp de 1 an
doar 4,60 EUR pe număr
Toate prețurile sunt prețuri NET.
TVA va fi adăugat mai târziu în casă.
Închiriați sau cumpărați articol
Obțineți acces limitat la timp sau la articol complet pe ReadCube.
Toate prețurile sunt prețuri NET.
Coduri de aderare
Aderări primare
Omnibus de expresie genică
Referințe
Gonzalez, E. și colab. Influența CCL3L1 genă - conținând duplicări segmentare ale sensibilității la HIV-1/SIDA. Ştiinţă 307, 1434–1440 (2005).
Hollox, E.J. și colab. Psoriazisul este asociat cu un număr crescut de copii genomice ale β-defensinei. Nat. Genet. 40, 23-25 (2008).
Fellermann, K. și colab. Un polimorfism cu grupe genetice de cromozom 8 cu un număr scăzut de copii ale genei β-defensinei 2 predispune la boala Crohn a colonului. A.m. J. Hum. Genet. 79, 439–448 (2006).
Aitman, T.J. și colab. Copiați numărul polimorfismului în Fcgr3 predispune la glomerulonefrita la șobolani și oameni. Natură 439, 851–855 (2006).
Eleftherohorinou, H. și colab. famCNV: asocierea variantei copiilor pentru trăsături cantitative în familii. Bioinformatică 27, 1873–1875 (2011).
Walley, A.J. și colab. Analiza diferențială a coexpresiei rețelelor asociate obezității în țesutul adipos subcutanat uman. Int. J. Obes. (Lond.) 36, 137-147 (2012).
Hysi, P.G. și colab. Un studiu de asociere la nivelul genomului pentru miopie și eroare de refracție identifică un locus de susceptibilitate la 15q25. Nat. Genet. 42, 902–905 (2010).
Field, S.F. și colab. Aspecte experimentale ale testelor variantei numărului de copii la CCL3L1. Nat. Med. 15, 1115–1117 (2009).
Hollox, E.J. în Variante structurale genomice Vol. 838 (ed. Feuk, L.) 187–207 (Springer New York, 2012).
Aldhous, M.C. și colab. Metode de măsurare și precizie în variația numărului de copii: eșecul de a reproduce asocierile numărului de copii β-defensinei cu boala Crohn. Zumzet. Mol. Genet. 19, 4930–4938 (2010).
Carpenter, D., Walker, S., Prescott, N., Schalkwijk, J. & Armor, J.A. Precizia și diferențierea diferențială în măsurarea numărului de copii CCL3L1 în studii de asociere cu trei tulburări autoimune. BMC Genomics 12, 418 (2011).
Sudmant, P.H. și colab. Diversitatea variației numărului de copii umane și a genelor multicopie. Ştiinţă 330, 641–646 (2010).
Balkau, B., Eschwege, E., Tichet, J. & Marre, M. Criterii propuse pentru diagnosticul diabetului: dovezi dintr-un studiu epidemiologic francez (D.E.S.I.R.). Diabet Metab. 23, 428–434 (1997).
Spector, T.D. & Williams, F.M. Registrul Twin Twin din Marea Britanie (TwinsUK). Twin Res. Zumzet. Genet. 9, 899–906 (2006).
Meyre, D. și colab. Studiul de asociere la nivelul genomului pentru obezitatea precoce și morbidă a adulților identifică trei noi loci de risc în populațiile europene. Nat. Genet. 41, 157–159 (2009).
Deci, H.C., Gui, A.H., Cherny, S.S. & Sham, P.C. Evaluarea eredității explicată prin variante de susceptibilitate cunoscute: o anchetă a zece boli complexe. Genet. Epidemiol. 35, 310-317 (2011).
Maes, H.H., Neale, M.C. & Eaves, L.J. Factori genetici și de mediu în greutatea corporală relativă și adipozitatea umană. Comportă-te. Genet. 27, 325–351 (1997).
Stuncard, A.J., Foch, T.T. & Hrubec, Z. Un studiu dublu asupra obezității umane. J. Am. Med. Conf. Univ. 256, 51-54 (1986).
Wen, W. și colab. Metaanaliza identifică variante comune asociate cu indicele de masă corporală la estul asiaticilor. Nat. Genet. 44, 307–311 (2012).
Perry, G.H. și colab. Dieta și evoluția variației numărului de copii ale genei amilazei umane. Nat. Genet. 39, 1256–1260 (2007).
Chatterton, R.T. Jr., Vogelsong, K.M., Lou, Y.C., Ellman, A.B. & Hudgens, G.A. A-amilaza salivară ca măsură a activității adrenergice endogene. Clin. Fiziol. 16, 433–448 (1996).
Park, K.S. Heritabilitatea activității urinei și amilazei plasmatice. Jinrui Idengaku Zasshi 22, 79-88 (1977).
Marques-Bonet, T. și colab. O explozie de duplicări segmentare în genomul strămoșului maimuței africane. Natură 457, 877–881 (2009).
Squires, B.T. Secreția amilazică salivară umană în raport cu dieta. J. Fiziol. (Lond.) 119, 153–156 (1953).
Mifflin, T.E., Hortin, G. & Bruns, D.E. Analize electroforetice ale izoenzimelor și izoformelor amilazei. Clin. Laborator. Med. 6, 583–599 (1986).
Mirski, A. Metabolismul țesutului adipos in vitro. Biochimie. . 36, 232–241 (1942).
Bingham, S.A. și colab. Metode nutriționale în ancheta prospectivă europeană a cancerului din Norfolk. Sănătate publică Nutr. 4, 847–858 (2001).
Kondo, T., Hayakawa, T., Shibata, T., Sato, Y. și Toda, Y. Nivelurile serice ale enzimelor pancreatice la subiecții slabi și obezi. Int. J. Pancreatol. 3, 241–248 (1988).
Schneeman, B.O., Inman, M.D. & Stern, J.S. Activitatea enzimei pancreatice la șobolanii obezi și slabi Zucker: un studiu de dezvoltare. J. Nutr. 113, 921–925 (1983).