HsaA - Monooxigenază dependentă de flavină, subunitate oxigenază HsaA - Mycobacterium tuberculosis (tulpină

Scorul adnotării: 5 din 5

hsaa

Scorul de adnotare oferă o măsură euristică a conținutului de adnotare al unei intrări sau proteome UniProtKB. Acest scor nu poti să fie utilizat ca o măsură a acurateței adnotării, deoarece nu putem defini „adnotarea corectă” pentru nicio proteină dată.

- Dovezi experimentale la nivel de proteine ​​i

Acest lucru indică tipul de dovezi care susține existența proteinei. Rețineți că dovada „existenței proteinelor” nu oferă informații cu privire la acuratețea sau corectitudinea secvențelor afișate.

Selectați o secțiune din stânga pentru a vedea conținutul.

Această secțiune oferă orice informații utile despre proteine, în principal cunoștințe biologice.

Informații curate manual pentru care există dovezi experimentale publicate.

Afirmație manuală bazată pe experiment în i

Diverse

Această subsecțiune a secțiunii Funcție descrie activitatea catalitică a unei enzime, adică o reacție chimică pe care enzima o catalizează.

Activitatea catalitică i

Afirmație manuală bazată pe experiment în i

Afirmație manuală bazată pe experiment în i

Afirmație manuală bazată pe experiment în i

Afirmație manuală bazată pe experiment în i

Afirmație manuală bazată pe experiment în i

Această subsecțiune a secțiunii „Funcție” descrie proprietățile biofizice și chimice, cum ar fi absorbția maximă, parametrii cinetici, dependența de pH, potențialele redox și dependența de temperatură.

  1. KM = 97 µM pentru 3-HSA (cu FAD la pH 7 și la 25 grade Celsius) 1 Publicație

Afirmație manuală bazată pe experiment în i

Afirmație manuală bazată pe experiment în i

Afirmație manuală bazată pe experiment în i

Afirmație manuală bazată pe experiment în i

Afirmație manuală bazată pe experiment în i

Această subsecțiune a secțiunii „Funcție” descrie căile metabolice asociate cu o proteină.

Calea i: biosinteza steroizilor

Site-uri

Această subsecțiune a secțiunii Funcție descrie interacțiunea dintre un singur aminoacid și o altă entitate chimică. Se acordă prioritate adnotării liganzilor fiziologici.

Regiuni

Această subsecțiune a secțiunii Funcție descrie o regiune din proteină care leagă fosfații nucleotidici. Implică întotdeauna mai mult de un aminoacid și include toate reziduurile implicate în legarea nucleotidelor.

Proiectul Gene Ontology (GO) oferă un set de vocabular controlat ierarhic împărțit în 3 categorii:

GO - Funcția moleculară i

  • Activitatea 3-hidroxi-9,10-secoandrosta-1,3,5 (10) -triena-9,17-dione monooxigenază Sursa: UniProtKB-EC
  • legarea flavinei adenine dinucleotidice Sursa: UniProtKB

Dedus din analiza directă

Folosit pentru a indica o analiză directă pentru funcția, procesul sau componenta indicată de termenul GO.

Mai multe informații în ghidul codului de probă GO

Dedus din analiza directă i

GO - Proces biologic i

  • proces catabolic compus aromatic Sursa: UniProtKB-KW
  • proces catabolic al colesterolului Sursa: MTBBASE dedusă din analiza directă i

    Se deduce din fenotipul mutant

    Descrie adnotările care se concluzionează din examinarea variațiilor sau modificărilor unui produs genetic, cum ar fi mutațiile sau nivelurile anormale și include tehnici precum eliminări, supraexpresie, experimente anti-simț și utilizarea inhibitorilor de proteine ​​specifice.

    Mai multe informații în ghidul codului de probă GO

    Se deduce din fenotipul mutant i

    Cuvintele cheie UniProtKB constituie un vocabular controlat cu o structură ierarhică. Cuvintele cheie rezumă conținutul unei intrări UniProtKB și facilitează căutarea proteinelor de interes.

    Funcția moleculară Monooxigenaza, Oxidoreductaza
    Proces biologic Catabolismul hidrocarburilor aromatice, degradarea lipidelor, metabolismul lipidelor, metabolismul steroizilor
    Ligand FAD, Flavoproteină, FMN

    Baze de date cu enzime și căi

    Colecția BioCyc de baze de date Pathway/Genome

    UniPathway: o resursă pentru explorarea și adnotarea căilor metabolice

    Baze de date chimice

    Resurse de cunoaștere SwissLipids pentru biologia lipidelor

    Această secțiune oferă informații despre numele și sinonimele (proteinele) și genele și despre organismul care este sursa secvenței de proteine.

    Nume și taxonomie i

    Această subsecțiune a secțiunii Nume și taxonomie oferă o listă exhaustivă a tuturor denumirilor proteinelor, de la cele utilizate în mod obișnuit până la învechire, pentru a permite identificarea fără echivoc a unei proteine.

    Afirmație manuală bazată pe experiment în i

    Această subsecțiune a secțiunii Nume și taxonomie indică numele (numele) genei care codifică secvența (secvențele) de proteine ​​descrise în intrare. Există patru jetoane distincte: „Nume”, „Sinonime”, „Nume de locus ordonat” și „Nume ORF”.

    Informații curate manual care se bazează pe afirmații din articole științifice pentru care nu există suport experimental.

    Afirmație manuală bazată pe opinie în i

    Această subsecțiune a secțiunii Nume și taxonomie oferă informații cu privire la numele (numele) organismului care este sursa secvenței de proteine.

    Această subsecțiune a secțiunii Nume și taxonomie arată identificatorul unic atribuit de NCBI organismului sursă al proteinei. Acesta este cunoscut sub numele de „identificator taxonomic” sau „taxid”.

    Această subsecțiune a secțiunii Numele și taxonomia conține linia de clasificare ierarhică taxonomică a organismului sursă. Acesta listează nodurile așa cum apar de sus în jos în arborele taxonomic, cu gruparea mai generală listată mai întâi.

    Această subsecțiune a secțiunii Nume și taxonomie este prezentă pentru intrările care fac parte dintr-un proteom, adică a unui set de proteine ​​considerate a fi exprimate de organisme ale căror genomi au fost complet secvențați.

    Un proteom UniProt poate consta din mai multe componente.
    Numele componentei se referă la componenta genomică care codifică un set de proteine.

    Baze de date specifice organismelor

    Baza de date a genomului tulpina H37Rv Mycobacterium tuberculosis

    Această secțiune oferă informații despre localizarea și topologia proteinei mature din celulă.

    Localizarea subcelulară i

    GO - Componenta celulară i

      membrana plasmatică Sursă: MTBBASE Se deduce din testul direct de mare randament i

      Această secțiune descrie modificările post-traducere (PTM) și/sau evenimentele de procesare.

      PTM/Procesare i

      Prelucrarea moleculelor

      Această subsecțiune a secțiunii „PTM/Prelucrare” descrie întinderea unui lanț polipeptidic în proteina matură după procesare sau scindare proteolitică.

      Baze de date proteomice

      PaxDb, o bază de date cu abundența de proteine ​​medii în toate cele trei domenii ale vieții

      Această secțiune oferă informații cu privire la expresia unei gene la nivelul ARNm sau proteine ​​în celule sau în țesuturile organismelor multicelulare.

      Această subsecțiune a secțiunii „Expresie” raportează efectele dovedite experimental ale inductorilor și represorilor (de obicei compuși chimici sau factori de mediu) asupra nivelului de exprimare a proteinelor (sau ARNm) (reglare ascendentă, reglare descendentă, expresie constitutivă).