Celule Evoluție clonală gratuită full-text a TP53 1G; gt; O mutație în pre- și post-neoadjuvant

Reprezentarea grafică a nivelurilor de CA-125 pe parcursul bolii/cursului de tratament al pacientului diagnosticat cu HGSOC. Se evidențiază cele două puncte de timp, la D-LPS (pre-NACT) și la IDS (post-NACT), în care au fost colectate probe de sânge și de țesut tumoral ovarian. CA-125: antigenul cancerului 125; D -LPS: laparoscopie diagnostic; NACT: chimioterapie neoadjuvantă; IDS: intervenție chirurgicală intermitentă; HGSOC: cancer ovarian seros de înaltă calitate.

celule

Reprezentarea grafică a VAF observată pentru SNV în TP53 identificată de NGS în probe de sânge (referință) și de țesut tumoral, colectate la pre-terapie (pre-NACT) la D-LPS și post-terapie (post-NACT) la IDS, de la un pacient cu HGSOC. (a) Graficul cu bare arată scăderea VAF în probele de tumori pre- (27,71%) și post-NACT (4,21%), indicând prevalența alelei WT „C” (bara albastră) comparativ cu bara alelei Alt „G”) la IDS pentru TP53 c.215C> G (p.P72R) SNP, prezent în heterozigoză (57,31%) în proba de referință de sânge; (b) Graficul cu bare arată creșterea VAF în probele tumorale pre- (50,13%) și post-NACT (94,33%), evidențiind prevalența alelei Alt „A” (bara roșie) comparativ cu alela WT „G” (bara verde) ) în proba de țesut HGSOC colectată la IDS de TP53 c.375 + 1G> O mutație, absentă în proba de referință a sângelui (numai alela WT „G”, bară verde). VAF: varianta de frecvență alelă; NACT: chimioterapie neoadjuvantă; HGSOC: cancer ovarian seros de înaltă calitate; D-LPS: laparoscopie diagnostic; IDS: intervenție chirurgicală intermitentă; Alt: alternativă; WT: de tip sălbatic.

Electroferograme Sanger confirmative ale variantelor TP53 identificate de NGS la un pacient cu HGSOC, în probe tumorale colectate la D-LPS (pre-NACT) și la IDS (post-NACT) și în referință (linia germinativă) probă de sânge. (a) Rezultatul secvențierii în proba de sânge de referință care arată polimorfismul TP53 c.215C> G în heterozigoză (cutie albastră) și alela WT „G” în poziția TP53 c.375 + 1G> G (cutia neagră); (b) Rezultatul secvențierii în proba tumorală colectată la D-LPS (pre-NACT) a polimorfismului TP53 c.215C> G (vârf crescut pentru alela WT „C”, cutie albastră) și mutație TP53 c.375 + 1G > A (heterozigoză, cutie roșie), în configurație trans; (c) Rezultatul secvențializării probei tumorale colectate la IDS (post-NACT) a polimorfismului TP53 c.215C> G indicând homozigoza alelei WT „C” sau pierderea alelei Alt „G” (casetă albastră) și mutație TP53 c.375 + 1G> A care indică homozigoza alelei mutate Alt „A” sau pierderea alelei WT „G” (casetă roșie), în configurație trans. HGSOC: cancer ovarian seros de înaltă calitate; D-LPS: laparoscopie diagnostic; IDS: intervenție chirurgicală intermitentă; NACT: chimioterapie neoadjuvantă; SNP: polimorfism unic nucleotidic; NGS: secvențierea de nouă generație; WT: de tip sălbatic.

Model reprezentativ al SNV-urilor TP53 duble în configurație trans identificate în proba HGSOC pre-NACT/chemo-naivă la D-LPS, cu expansiune clonă și LOH somatică în proba tumorală post-NACT colectată la IDS. În celulele normale (sânge) la nivelul liniei germinale, a fost detectat doar TP53 SNP c.215C> G; în proba chimio-naivă/netratată (Tumoră pre-NACT), mutația splice TP53 c.375 + 1G> A a fost prezentă cu alela Alt minoră în trans la alela WT a polimorfismului TP53 c.215C> G; în eșantionul post-terapie/tratat (tumoră post-NACT), s-a observat expansiunea completă a clonei cu LOH somatic cu pierderea alelei minore Alt pentru TP53 c.215C> G SNP și pierderea alelei WT pentru TP53 c.375 + 1G> O mutație. Alela altă a mutației TP53 c.375 + 1G> A este reprezentată în roșu, WT de referință în verde; Alela altă a polimorfismului TP53 c.215C> G este colorată în portocaliu, alela de referință WT în albastru; alelele minore Alt sunt cu litere mici, alelele WT sunt cu litere mari. VAF: varianta de frecvență alelă; NACT: chimioterapie neoadjuvantă; HGSOC: cancer ovarian seros de înaltă calitate; D-LPS: laparoscopie diagnostic; IDS: intervenție chirurgicală intermitentă; Alt: alternativă; WT: de tip sălbatic; LOH: pierderea heterozigozității.